助理研究员(专职科研)
蛋白质设计旨在设计能够折叠成期望结构并具有相应功能的蛋白质。蛋白质设计是蛋白质工程的核心问题,例如利用蛋白质设计提高酶的催化效率、抗体的亲和性等。基于人工智能算法构建蛋白质设计方法,并将该模型应用于CALB等蛋白设计,提高该酶的催化效率等。
蛋白设计网站:https://proteindesign.sjtu.edu.cn/GPDGenerator/
组织病理学图像作为肿瘤诊断和分级的临床金标准,指导临床医生做出更精确的治疗决策。病理学家通过在显微镜下评估肿瘤细胞的形态等特征进行分级。然而,手动评估组织病理学图像是非常耗时、主观且不可重复的。基于组织病理学图像开发人工智能模型直接预测患者生存风险,该辅助工具可以用来提高病理学家的效率和准确性,并最终为患者提供更好的治疗。特别是对于偏远地区医师资源的情况,该模型具有重要意义和应用场景。
在线分析网站:https://yu.www.jeffleenovels.com/DeepCoxSC
蛋白质设计旨在设计能够折叠成期望结构并具有相应功能的蛋白质。蛋白质设计是蛋白质工程的核心问题,例如利用蛋白质设计提高酶的催化效率、抗体的亲和性等。基于人工智能算法构建蛋白质设计方法,并将该模型应用于CALB等蛋白设计,提高该酶的催化效率等。
蛋白设计网站:https://proteindesign.sjtu.edu.cn/GPDGenerator/
组织病理学图像作为肿瘤诊断和分级的临床金标准,指导临床医生做出更精确的治疗决策。病理学家通过在显微镜下评估肿瘤细胞的形态等特征进行分级。然而,手动评估组织病理学图像是非常耗时、主观且不可重复的。基于组织病理学图像开发人工智能模型直接预测患者生存风险,该辅助工具可以用来提高病理学家的效率和准确性,并最终为患者提供更好的治疗。特别是对于偏远地区医师资源的情况,该模型具有重要意义和应用场景。
在线分析网站:https://yu.www.jeffleenovels.com/DeepCoxSC
Ting Wei#; Xin Yuan; Ruitian Gao; Luke Johnston; Jie Zhou; Yifan Wang; Weiming Kong; Yujing Xie; Yue Zhang; Dakang Xu*; Zhangsheng Yu*; Survival Prediction of Stomach Cancer Using Expression Data and Deep Learning Models with Histopathological Image, Cancer Science, 2022, 114(2):690-701. (IF=6.518)
(*代表通讯作者,#共同第一作者)
Ruitian Gao#; Shuai Zhao#; Kedeerya Aishanjiang#; Hao Cai#; Ting Wei#; Yichi Zhang; Zhikun Liu; Jie Zhou; Bing Han; Jian Wang; Han Ding; Yingbin Liu; Xiao Xu; Zhangsheng Yu*; Jinyang Gu*; Deep learning for differential diagnosis of malignant hepatic tumors based on multi-phase contrast-enhanced CT and clinical data, Journal of Hematology & Oncology, 2021, 14(1):154. (IF=23.168)
Ting Wei#; Botao Fa; Chengwen Luo; Luke Johnston; Yue Zhang; Zhangsheng Yu*; An efficient and easy-to-use network-based integrative method of multi-omics data for cancer genes discovery, Frontiers in Genetics, 2021, 11:613033. (IF=4.772)
Hanyi Chen#; Ting Wei#; Haiyin Wang#; Yi Zhou; Hua Chen; Lianghong Sun; Shaotan Xiao; Wuren Ma; Huijuan Zhao; Guanghua Chen; Xinlei Liang; Donglan Zhang; Weiwei Zheng*; Yixin Zhou*; Zhangsheng Yu*; Association of China’s two-child policy with changes in number of births and birth defects rate, 2008–2017, BMC Public Health, 2022, 22(1):434. (IF=4.135)
Yuan Zhou#; Botao Fa; Ting Wei; Jianle Sun; Zhangsheng Yu*; Yue Zhang*; Elastic Correlation Adjusted Regression (ECAR) scores for high dimensional variable importance measuring, Scientific Reports, 2021, 11(1):23354. (IF=3.998)
Xin Yuan#; Shuangge Ma; Botao Fa; Ting Wei; Yanran Ma; Yifan Wang; Wenwen Lv; Yue Zhang; Junke Zheng; Guoqiang Chen; Jing Sun; Zhangsheng Yu*; A high-efficiency differential expression method for cancer heterogeneity using large-scale single-cell RNA-sequencing data, Frontiers in Genetics, 2022, 13:1063130. (IF=4.772)
Xiaokun Hong#; Kaiyuan Song; Mueed Ur Rahman; Ting Wei; Yan Zhang; Lin-Tai Da*; Hai-Feng Chen*; Phosphorylation Regulation Mechanism of β2 Integrin for the Binding of Filamin Revealed by Markov State Model, Journal of Chemical Information and Modeling, 2023, 63(2):605-618. (IF=6.162)